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“活化石”魚類，指在漫長的地質歷史中，保持著極為古老且形態特征穩定的物種，如矛尾魚、肺魚、雀鱔等。這些譜系通常經歷了數億年的演化，但其形態、生態甚至基因組結構卻變化緩慢，展現出遠低于大多數現代魚類的演化速率。因此，它們保留了大量來自地質歷史深處的生物學信息，是探索魚類多樣化進程、脊椎動物關鍵演化創新（例如水生到陸生的轉變）、以及基因組演化模式的重要研究對象。日前，中國科學院水生生物研究所團隊等，深入研究了雀鱔目魚類形態變化緩慢的基因組學機制并取得進展。團隊基于鱷雀鱔與長吻雀鱔的染色體級基因組，發現兩個屬魚類在染色體結構上存在融合事件，并具有保守性。研究發現，兩個屬魚類在分化超過1億年后，依然有83.35%的基因組完全一致，且基因組大小差異大多數源于單堿基的插入/缺失，而非大規模結構變化。研究進一步指出，微染色體結構比大染色體穩定，且明顯富集于DNA修復與細胞凋亡相關基因，演化速率緩慢，染色體重排率僅約0.5次/百萬年。同時，兩個屬魚類與四足動物的基因組相似度，甚至高于近緣的真骨魚類，且轉座元件的產生率與活躍度在脊椎動物中最低，團隊推測，其低活性是維持基因組穩定性的重要原因。白堊紀分化的兩個屬在現生環境中，仍可跨屬雜交并產生可存活后代。群體基因組分析顯示，兩個屬雖存在明顯的譜系分化，但歷史上仍有有限的基因流事件，這種持續的雜交能力或源于它們長期的基因組結構保守與低分子不相容性。相關研究成果發表在《基因組研究》（Genome Research）上。論文鏈接“活化石”魚類基因組演化研究獲進展